El Museo de Montserrat lo configuran diversas colecciones que, desde el año 1996, están ubicadas en un mismo edificio. A las colecciones permanentes se añaden las exposiciones temporales que se pueden ver en las dos salas destinadas a este fin: la Sala Daura y el Espai d'Art Pere Pruna.
El espacio que ocupa el museo es interesante por sí mismo; fue proyectado por Josep Puig i Cadafalch en 1929 dentro del proyecto general de reforma de las plazas del monasterio. Desde el verano de 2004, el Museo de Montserrat dispone de una nueva entrada, sin barreras arquitectónicas.
Actualmente, el museo tiene un servicio de visitas comentadas para grupos y escuelas, y también audioguías.
El Museo de Montserrat está formado por seis colecciones diferentes. Los objetos expuestos, más de 1.300 piezas, abarcan un período cronológico muy amplio. La pieza más antigua es un sarcófago egipcio del siglo XXII a. C., y la más reciente, una pintura de Sean Scully, La montaña d'Oisin (2010) donada por el propio artista.
El sarcófago pertenece a la colección Arqueología del Oriente Bíblico, junto a otros objetos representativos de las culturas de Mesopotamia, Egipto, Grecia, Tierra Santa y Chipre.
La obra de Scully está situada en la exposición de Pintura de los siglos XIX y XX , una de las mejores colecciones de pintura catalana, con nombres tan relevantes como Fortuny, Rusiñol, Casas, Nonell, Mir, Gimeno, Anglada Camarasa, Picasso, Dalí, etc. También podemos ver una representación del impresionismo francés, con obras de Monet, Sisley, Degas, Pissarro, etc., y una muestra de obra gráfica de pintores de fama reconocida que pertenecen a la estética contemporánea: Chagall, Braque, Le Corbusier, Rouault, Miró, Dalí, Picasso, Clavé, Tàpies, entre otros.
Desde el año 2006, el MDM cuenta con una nueva sección: una colección de 160 iconos bizantinos y eslavos, bajo el título Phos Hilaron (luz jubilosa), que se presentan en el ambiente de una iglesia oriental, donde la luz juega un papel determinante.
El resto de colecciones son: Iconografía de Santa María de Montserrat, en la que se puede seguir la evolución que se ha producido en la representación de la Virgen de Montserrat a través de los tiempos; Orfebrería, con un conjunto de objetos litúrgicos del siglo XV al XX y Pintura del siglo XIII al XVIII, con obras de Berruguete, el Greco, Caravaggio, Luca Giordano, Tiepolo, entre otros.
