Le Musée de Montserrat abrite différentes collections, toutes situées dans un même bâtiment depuis 1996. Des collections temporaires viennent s'ajouter aux collections permanentes. Elles se situent dans deux salles prévues à cet effet : Sala Daura et Espai Pere Pruna.
La bâtisse du musée est également digne d'intérêt. Elle est l'œuvre de Josep Puig i Cadafalch qui, en 1929, collabore au projet de rénovation générale des places du monastère. Au cours de l'été 2004, le Musée de Montserrat fait construire une nouvelle entrée, en prenant le soin d'éliminer les barrières architecturales.
Aujourd'hui, le musée propose des visites guidées pour les groupes et les écoles et fournit également des audioguides.
Le Musée de Montserrat abrite six collections très différentes les unes des autres. Les objets exposés, plus de 1 300 pièces, couvrent une très longue période de temps. La plus ancienne pièce est un sarcophage égyptien datant du XXIIE siècle av. J-C, et la plus récente est une sculpture de Josep M. Subirachs datant de 2001.
Il est possible de voir ce sarcophage dans la collection Archéologie de l'Orient biblique, aux côtés d'autres objets provenant de Mésopotamie, d'Égypte, de Grèce, de Terre Sainte et de Chypre.
La sculpture de Josep M. Subirachs est une interprétation de Notre-Dame de Montserrat et fait partie de l'exposition consacrée à l'Iconographie de la Vierge de Montserrat, où l'on peut suivre l'évolution de la représentation de la Vierge au fil du temps.
Depuis 2006, le MDM compte une nouvelle section : une collection de 160 icônes byzantines et slaves dont le titre est Phos Hilaron (lumière joyeuse). Elles sont mises en scène comme si elles se trouvaient dans une église orientale, où la lumière joue un rôle déterminant.
Le reste des collections sont Orfèvrerie, avec un ensemble d'objets liturgiques allant du XVE au XXE siècle ; Peinture du XIIIE au XVIIIEsiècle, avec des tableaux de Berruguete, El Greco, Caravage, Luca Giordano, Tiepolo, entre autres ; et Peinture des XIXE et XXEsiècles, l'une des meilleures collections de la peinture catalane, avec des noms aussi célèbres que Fortuny, Rusiñol, Casas, Nonell, Mir, Gimeno, Anglada Camarasa, Picasso, Dalí, entre autres. L'impressionnisme français n'est pas en reste avec des œuvres de Monet, Sisley, Degas, Pissarro et d'autres. On peut aussi voir quelques tableaux de peintres contemporains célèbres : Chagall, Braque, Le Corbusier, Rouault, Miró, Dalí, Picasso, Clavé, Tàpies, entre autres.
