La topografia scoscesa e accidentata della montagna, insieme agli improvvisi cambi di altitudine, fa sì che il clima di Montserrat presenti forti contrasti in spazi ridotti; pertanto, è meglio parlare di microclimi piuttosto che di un unico clima generale.

Secondo i dati della stazione meteorologica del monastero, situata a 740 m di altezza, le precipitazioni medie annuali ammontano a 678 l/m². La temperatura media annuale è compresa fra i 13 e i 14º C. L'influsso dell'aria marittima è notevole, poiché permette la formazione di nebbie, spesso molto dense, che provocano un significativo livello di umidità, con effetti benefici sulla vegetazione. Le nevicate sono poco frequenti, ma di tanto in tanto si verifica qualche nevicata abbondante.