Zróżnicowana i gwałtowna topografia terenu górskiego z dużymi różnicami wysokości sprawia, że klimat w Montserrat jest naprawdę zróżnicowany, mimo niewielkich rozmiarów wzgórza. Możemy więc raczej mówić o mikroklimatach, a nie o klimacie ogólnie.
Zgodnie z danymi klasztornej stacji meteorologicznej mieszczącej się na wysokości 740 m, średnie roczne opady wynoszą 678 l/ m². Roczna średnia temperatura wynosi od 13 do 14°C. Wpływ bryzy morskiej jest zauważalny, ponieważ powoduje ona tworzenie się mgły, często dość gęstej, co przyczynia się do zwiększenia wilgotności i tym samym sprzyja wzrostowi roślinności. Opady śniegu są dość rzadkie, jednak czasami zdarzają się dość obfite burze